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新冠檢測(cè)為何有假陰性?北京疾控中心等發(fā)現(xiàn):或因樣本熱滅活
最后更新: 2020-05-19 07:48:55自2019年底新冠疫情暴發(fā),核酸檢測(cè)對(duì)患者診斷和疾控管理發(fā)揮了重要作用。然而實(shí)際檢測(cè)中,卻經(jīng)常有假陰性的情況發(fā)生。假陰性可能會(huì)導(dǎo)致病毒攜帶者被漏診,尚無(wú)康復(fù)的患者誤出院,以及輸血中的一些潛在安全問(wèn)題。
那么假陰性的原因有哪些?來(lái)自中國(guó)的研究發(fā)現(xiàn),對(duì)檢測(cè)樣本的熱滅活,可能是假陰性的一大原因。當(dāng)?shù)貢r(shí)間5月15日,美國(guó)臨床化學(xué)協(xié)會(huì)與牛津大學(xué)出版社合作出版的國(guó)際領(lǐng)先的臨床實(shí)驗(yàn)室科學(xué)期刊Clinical Chemistry刊發(fā)了來(lái)自北京疾病預(yù)防控制中心、北京市預(yù)防醫(yī)學(xué)研究中心、首都醫(yī)科大學(xué)、中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院老年醫(yī)學(xué)研究院、中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院和北京醫(yī)院的論文“Potential False-Negative Nucleic Acid Testing Results for Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 from Thermal Inactivation of Samples with Low Viral Loads”。
論文稱:為了安全,國(guó)家衛(wèi)健委相關(guān)指南要求在提取樣本核酸前需將樣本置于56℃以上以滅活病毒。但是,熱滅活本身可能會(huì)破壞作為單鏈RNA的新冠病毒的核酸完整性,并在RT-PCR測(cè)試中出現(xiàn)假陰性。
這項(xiàng)研究的通訊作者為北京市疾控中心傳染病地方病控制所所長(zhǎng)、研究員王全意和來(lái)自中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院老年醫(yī)學(xué)研究院的任思楣。
研究團(tuán)隊(duì)調(diào)查了熱滅活是否會(huì)影響病毒核酸檢測(cè)的結(jié)果。研究者檢查了熱滅活對(duì)SARS-CoV-2定量RT-PCR結(jié)果的影響,特別是對(duì)于攜帶低病毒載量的標(biāo)本的假陰性結(jié)果的比率。研究者還探討了不同樣品類型,樣品保存時(shí)間和化學(xué)滅活方法對(duì)核酸檢測(cè)的影響。
目前,中國(guó)已有100多家企業(yè)開發(fā)了用于新冠核酸檢測(cè)的試劑盒,其中9個(gè)已獲得國(guó)家藥品監(jiān)督管理局的批準(zhǔn)。經(jīng)過(guò)國(guó)家藥品監(jiān)督管理局批準(zhǔn)的試劑盒,在臨床試驗(yàn)中對(duì)確診病例的樣品均顯示出90%以上的高靈敏度。但是,在實(shí)際的臨床環(huán)境中,疑似患者的陽(yáng)性診斷率沒(méi)有評(píng)估的那么高。許多疑似患者表現(xiàn)出與肺炎一致的典型臨床癥狀或影像學(xué)研究,但在RT-PCR測(cè)試中未發(fā)現(xiàn)陽(yáng)性。這就提出了一個(gè)問(wèn)題,是什么導(dǎo)致這些臨床上的假陰性?
國(guó)家藥品監(jiān)督管理局批準(zhǔn)的試劑盒通常來(lái)說(shuō)質(zhì)量都是非常高的,而操作者也不太可能因?yàn)楹怂崽崛『蜋z測(cè)程序不當(dāng)產(chǎn)生大量假陰性。那么,臨床上收集的樣品類型(比如,是熱滅活還是化學(xué)滅活)可能是導(dǎo)致RT-PCR測(cè)試性能低于預(yù)期的主要原因之一。
考慮到SARS-CoV-2是單鏈RNA病毒,分離其基因組需要謹(jǐn)慎處理樣品,并保持良好的實(shí)驗(yàn)室操作規(guī)范。SARS-CoV-2具有很強(qiáng)的傳染性,許多實(shí)驗(yàn)室在提取RNA之前,已對(duì)樣本進(jìn)行56-60°C滅活30-60分鐘,以保證操作人員的安全。盡管學(xué)術(shù)界懷疑這種預(yù)處理可能會(huì)影響低病毒載量樣品中SARS-CoV-2的檢測(cè),但對(duì)其影響的定量分析仍然不足。此次研究中,研究者調(diào)查了熱滅活對(duì)SARS-CoV-2核酸檢測(cè)結(jié)果的定量影響,并評(píng)估了由于熱滅活引起的假陰性率。研究者進(jìn)一步研究了不同樣品類型,樣品保存時(shí)間和化學(xué)滅活方法對(duì)核酸檢測(cè)的影響。
該研究顯示,從確診的COVID-19患者的標(biāo)本經(jīng)過(guò)熱孵育后,在RT-PCR測(cè)試時(shí)Ct值較熱滅活前的樣板升高(編注:Ct值與病毒載量成反比,Ct值升高,意味著測(cè)試出的病毒載量偏低)。此外,在至少一項(xiàng)平行測(cè)試中,加熱滅活后的的弱陽(yáng)性樣品中約一半(15個(gè)樣品中的7個(gè),占46.7%)成為RT-PCR陰性。研究者發(fā)現(xiàn),與熱滅活相比,使用胍鹽裂解法保存這些樣品對(duì)RT-PCR結(jié)果的影響較小,假陰性更少(15個(gè)樣品中的2個(gè),占13.3%),Ct值的增加也明顯更少。
本研究采用的樣本來(lái)自北京23名已確診的新冠患者。研究收集了19個(gè)咽拭子,2個(gè)痰樣本和2個(gè)糞便樣本。將4支咽拭子和痰標(biāo)本保存在3 μmL標(biāo)準(zhǔn)病毒運(yùn)輸液(VTM)中。其他15支弱陽(yáng)性喉拭子保存在3 μmL標(biāo)準(zhǔn)病毒運(yùn)輸液或者3 μmL的化學(xué)滅活的緩沖液中。糞便樣本保存在采樣管中。所有樣品都保持在4°C并在4小時(shí)內(nèi)轉(zhuǎn)移到實(shí)驗(yàn)室。
研究發(fā)現(xiàn)熱滅活可以導(dǎo)致RT-PCR檢測(cè)中病毒核酸的可檢測(cè)量減少和Ct值增加(Ct值與病毒載量成反比),這一結(jié)果與最近的豬流行性腹瀉病毒模型的研究結(jié)果一致。熱滅活對(duì)攜帶高病毒載量的標(biāo)本的定性結(jié)果沒(méi)有顯著影響。但是,對(duì)于弱陽(yáng)性樣本(Ct值范圍為33.37至36.89),熱滅活可能是實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)SARS-CoV-2時(shí)假陰性結(jié)果的可能原因之一。
據(jù)推測(cè),熱失活可能會(huì)對(duì)早期感染患者的檢測(cè)產(chǎn)生潛在影響,導(dǎo)致核酸檢測(cè)無(wú)法在患者病毒載量尚低時(shí)就檢測(cè)出來(lái)。在研究中,近一半的弱陽(yáng)性樣本(15個(gè)樣本中的7個(gè),占46.7%)顯示假陰性結(jié)果。這7個(gè)樣本的平均Ct值(36.25)相當(dāng)于約700拷貝/ mL,這也可能是熱敏感的可能閾值。
因此,研究者呼吁,迫切需要提高實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)的準(zhǔn)確率。采用化學(xué)滅活劑,例如胍鹽類的RNA樣本保存制劑,可以視為避免生物安全風(fēng)險(xiǎn)的替代方法。研究結(jié)果表明,與低病毒載量樣品中的熱滅活相比,這些滅活劑可能有更好的測(cè)定性能和檢測(cè)率。但是,化學(xué)滅活劑的狹窄適用性,有限的可獲得性和潛在的環(huán)境污染,限制了它們?cè)赟ARS-CoV-2測(cè)試中的應(yīng)用。
附:實(shí)驗(yàn)結(jié)果
標(biāo)簽 新冠病毒- 原標(biāo)題:新冠檢測(cè)為何有假陰性?北京疾控中心等發(fā)現(xiàn):或因樣本熱滅活
- 責(zé)任編輯: 于文凱 
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